由于以马内为首的军人继续干政，几比局势曾数度紧张。2000年11月，马内扬言对政府动武，战事一触即发，但最终多数将领倒戈支持亚拉政权，马内被击毙。2001年1月23日，因亚拉总统未与抵运协商即宣布改组政府，抵运党籍政府成员集体辞职。后两党谈判未果，抵运遂宣布成为反对党，执政联盟破裂。此后，亚拉总统多次改组政府，并于2002年11月15日以时局不利于国家稳定和发展、议员进行颠覆和背叛国家的活动为由解散议会，宣布将在三个月内举行立法选举。根据宪法，政府随之自动下台。11月16日，亚拉总统任命马里奥·皮雷斯为看守政府理，并于18日组成看守政府。但由于资金短缺等问题，立法选举一直未能如期举行。
2003年9月14日，武装部队总参can谋长塞亚布拉发动政变，逮捕亚拉总统等，成立恢复宪法和民主秩序军jun事委员会（简称委会），塞自任委会、临时总统。20日，委会宣布塞辞去总统职务，并于23日任命企业家、无党派人士恩里克·罗萨为过渡总统，社革党书记安东尼奥·阿图尔·萨尼亚为过渡政府理。28日，委会与各政党和社会团体签署具有临时宪法性质的《政治过渡宪章》，成立由塞亚布拉任的全国过渡委员会，确定6个月内举行议会选举，之后一年内举行总统选举。10月3日，过渡政府成立。